Cyclic five-membered phosphinate esters as transition state analogues for obtaining phosphohydrolase antibodies
Notice bibliographique
Résumé
Two novel cyclic five-membered phosphinate esters (6 and 7) were synthesized and used as transition state analogues (TSAs) for raising phosphohydrolase antibodies. The key step in the syntheses was a McCormack reaction between (2-chloroethyl)dichlorophosphite and 1,4-diphenyl-1,3-butadiene to form isomeric cyclic phosphinyl chlorides which upon further elaboration yielded the TSAs. X-ray crystal structures of two cyclic phosphinate TSA precursors (14a and 14b) show highly compressed CPC bond angles of 94°-97° indicating that the CPC bond angles in 6 and 7 are significantly distorted towards the ideal trigonal bipyramidal equatorial-apical transition state angle of 90° formed during phosphate ester hydrolysis. Antibodies were raised to 6 and 7 using standard hybridoma technology. One antibody, Jel 541, an IgM class antibody, was obtained that was capable of catalyzing the hydrolysis of phosphonate substrate 9 and, to a much lesser extent, phosphate substrate 8. This antibody bound TSA 6 approximately 100 times more tightly than TSA 7 as determined by solid phase radio immune assays. The activity of the antibody-catalyzed reaction was completely inhibited by the presence of TSA6. Although the relative instability and poor solubility of Jel 541 made it impossible to perform a detailed kinetic analysis of the antibody-catalyzed reactions, these results demonstrate that phosphohydrolase antibodies can indeed be obtained using cyclic five membered phosphinates as haptens.Key words: transition state analogues, phosphate ester hydrolysis, catalytic antibodies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».