MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2091630495 · doi:10.1139/v00-068

Cyclic five-membered phosphinate esters as transition state analogues for obtaining phosphohydrolase antibodies

2000· article· en· W2091630495 sur OpenAlexvenueno aff
Gabriel Hum, Krista Wooler, Jeremy Lee, Scott D. Taylor

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésChemistryPhosphinateHydrolysisPhosphonateHaptenTransition state analogStereochemistryCatalysisTrigonal bipyramidal molecular geometrySubstrate (aquarium)AntibodyPhosphateOrganic chemistryCrystal structureActive site

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two novel cyclic five-membered phosphinate esters (6 and 7) were synthesized and used as transition state analogues (TSAs) for raising phosphohydrolase antibodies. The key step in the syntheses was a McCormack reaction between (2-chloroethyl)dichlorophosphite and 1,4-diphenyl-1,3-butadiene to form isomeric cyclic phosphinyl chlorides which upon further elaboration yielded the TSAs. X-ray crystal structures of two cyclic phosphinate TSA precursors (14a and 14b) show highly compressed CPC bond angles of 94°-97° indicating that the CPC bond angles in 6 and 7 are significantly distorted towards the ideal trigonal bipyramidal equatorial-apical transition state angle of 90° formed during phosphate ester hydrolysis. Antibodies were raised to 6 and 7 using standard hybridoma technology. One antibody, Jel 541, an IgM class antibody, was obtained that was capable of catalyzing the hydrolysis of phosphonate substrate 9 and, to a much lesser extent, phosphate substrate 8. This antibody bound TSA 6 approximately 100 times more tightly than TSA 7 as determined by solid phase radio immune assays. The activity of the antibody-catalyzed reaction was completely inhibited by the presence of TSA6. Although the relative instability and poor solubility of Jel 541 made it impossible to perform a detailed kinetic analysis of the antibody-catalyzed reactions, these results demonstrate that phosphohydrolase antibodies can indeed be obtained using cyclic five membered phosphinates as haptens.Key words: transition state analogues, phosphate ester hydrolysis, catalytic antibodies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Chemistry→Même sujetMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research→Travaux en français237 207→