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Enregistrement W2091667684 · doi:10.1139/g04-015

Paraoxical relationship between protein content and nucleolar activity in mammalian cardiomyocytes

2004· article· en· W2091667684 sur OpenAlexvenueno aff
Olga V. Anatskaya, Alexander E. Vinogradov

Notice bibliographique

RevueGenome · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRussian Academy of SciencesRussian Foundation for Basic Research
Mots-clésBiologyPolyploidPloidyGenome sizeTranscriptomeGenomeGeneRibosome biogenesisGeneticsNucleolusGene expressionCell biologyMolecular biologyRibosomeRNACytoplasm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It was recently demonstrated that polyploidization of the avian myocardium is associated with a reduction of cardiac aerobic capacity evaluated by the heart mass to body mass ratio (heart index). To investigate possible cellular correlates of polyploidization, the protein content and nucleolar activity per cell and per genome were examined by image cytometry in 21 mammalian species, differing in the degree of heart polyploidization and heart index. We found that average cardiomyocyte ploidy level correlates negatively with the animal heart index (r = -0.75, p < 10(-4)), i.e., the large heart of athletic mammals is polyploidized to a lesser degree than the relatively smaller heart of sedentary species, which confirms the picture observed in birds. The protein content per genome decreased with the elevation of cardiomyocyte ploidy level. This inverse correlation was especially pronounced with the removed effect of body mass (r = -0.79, p < 10(-4)). Surprisingly, these changes were accompanied by the increase of nucleolar activity per genome (r = 0.61, p < 10(-3)). In the two species, for which the microarray gene expression data were available (human and mouse), this increase was paralleled by the elevated expression of ribosomal protein genes (but there was no increase in the expression of tissue-specific genes). Thus, in the polyploid cardiomyocytes there is a misbalance between protein content per genome and ribosome biogenesis. The reduction of protein content (per genome) of polyploid cardio my ocytes should further curtail heart functionality (in addition to reduction of heart index), because it is known that cardio myocyte protein content consists of more than 90% contractile proteins. This finding makes doubtful a widespread notion that polyploidization is necessary for cell function. Because somatic polyploidization is associated with stressful conditions and impaired energetics, we suppose that additional genomes can serve for cell regeneration and as a defense against oxidative damage in the organs that work at the limit of their metabolic capacity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,609
Score d'incertitude au seuil0,127

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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