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Enregistrement W2091671568 · doi:10.1104/pp.113.218610

A Common Fungal Associate of the Spruce Bark Beetle Metabolizes the Stilbene Defenses of Norway Spruce   

2013· article· en· W2091671568 sur OpenAlexaff
Almuth Hammerbacher, Axel Schmidt, Namita Wadke, Louwrance P. Wright, Bernd Schneider, Jöerg Bohlmann, Willi A. Brand, Trevor M. Fenning, Jonathan Gershenzon, Christian Paetz

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest Insect Ecology and Management
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésCeratocystisPicea abiesBark beetleBark (sound)BiologyFungusHost (biology)BotanyAscomycotaMicrobiologyGeneBiochemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Norway spruce (Picea abies) forests suffer periodic fatal attacks by the bark beetle Ips typographus and its fungal associate, Ceratocystis polonica. Norway spruce protects itself against fungal and bark beetle invasion by the production of terpenoid resins, but it is unclear whether resins or other defenses are effective against the fungus. We investigated stilbenes, a group of phenolic compounds found in Norway spruce bark with a diaryl-ethene skeleton with known antifungal properties. During C. polonica infection, stilbene biosynthesis was up-regulated, as evidenced by elevated transcript levels of stilbene synthase genes. However, stilbene concentrations actually declined during infection, and this was due to fungal metabolism. C. polonica converted stilbenes to ring-opened, deglycosylated, and dimeric products. Chromatographic separation of C. polonica protein extracts confirmed that these metabolites arose from specific fungal enzyme activities. Comparison of C. polonica strains showed that rapid conversion of host phenolics is associated with higher virulence. C. polonica is so well adapted to its host's chemical defenses that it is even able to use host phenolic compounds as its sole carbon source.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations159
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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