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Enregistrement W2091818162 · doi:10.1021/jm2007062

Optimization of the Potency and Pharmacokinetic Properties of a Macrocyclic Ghrelin Receptor Agonist (Part I): Development of Ulimorelin (TZP-101) from Hit to Clinic

2011· article· en· W2091818162 sur OpenAlexaff
Hamid R. Hoveyda, Éric Marsault, René Gagnon, Axel Mathieu, Martin Vézina, A. Landry, Zhigang Wang, Kamel Benakli, S. Beaubien, Carl Jacky Saint‐Louis, M. Brassard, J.-F. Pinault, L. Ouellet, Shridhar Bhat, Mahesh Ramaseshan, Xiaowen Peng, L. Foucher, Sophie Beauchemin, P. Bherer, Daniel F. Veber, Mark L. Peterson, Graeme L. Fraser

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueRegulation of Appetite and Obesity
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryGhrelinPharmacokineticsPotencyAgonistAequorinReceptorPharmacologyHigh-throughput screeningIn vitroIn vivoBioavailabilityPeptidomimeticEC50StereochemistryCombinatorial chemistryBiochemistryPeptideMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-throughput screening of Tranzyme Pharma's proprietary macrocycle library using the aequorin Ca2+-bioluminescence assay against the human ghrelin receptor (GRLN) led to the discovery of novel agonists against this G-protein coupled receptor. Early hits such as 1 (Ki=86 nM, EC50=134 nM) though potent in vitro displayed poor pharmacokinetic properties that required optimization. While such macrocycles are not fully rule-of-five compliant, principally due to their molecular weight and clogP, optimization of their pharmacokinetic properties proved feasible largely through conformational rigidification. Extensive SAR led to the identification of 2 (Ki=16 nM, EC50=29 nM), also known as ulimorelin or TZP-101, which has progressed to phase III human clinical trials for the treatment of postoperative ileus. X-ray structure and detailed NMR studies indicated a rigid peptidomimetic portion in 2 that is best defined as a nonideal type-I' β-turn. Compound 2 is 24% orally bioavailable in both rats and monkeys. Despite its potency, in vitro and in gastric emptying studies, 2 did not induce growth hormone (GH) release in rats, thus demarcating the GH versus GI pharmacology of GRLN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,523

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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