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Enregistrement W2091820907 · doi:10.1002/ajmg.b.32236

Adult neuropsychiatric expression and familial segregation of 2q13 duplications

2014· article· en· W2091820907 sur OpenAlexafffund
Gregory Costain, Anath C. Lionel, Fiona Fu, Dimitri J. Stavropoulos, Matthew J. Gazzellone, Christian R. Marshall, Stephen W. Scherer, Anne S. Bassett

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part B Neuropsychiatric Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversity Health NetworkHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesWellcome TrustCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Ottawa
Mots-clésProbandGeneticsCopy-number variationAutismGenotypingBiologyGene duplicationComparative genomic hybridizationSchizophrenia (object-oriented programming)MedicineGenomeMutationGeneGenotypePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

New genomic disorders associated with large, rare, recurrent copy number variations (CNVs) are being discovered at a rapid pace. Detailed phenotyping and family studies are rare, however, as are data on adult phenotypic expression. Duplications at 2q13 were recently identified as risk factors for developmental delay/autism and reported in the prenatal setting, yet few individuals (all children) have been extensively phenotyped. During a genome-wide CNV study of schizophrenia, we identified two unrelated probands with 2q13 duplications. In this study, detailed phenotyping and genotyping using high-resolution microarrays was performed for 12 individuals across their two families. 2q13 duplications were present in six adults, and co-segregated with clinically significant later-onset neuropsychiatric disorders. Convergent lines of evidence implicated GABAminergic dysfunction. Analysis of the genic content revealed promising candidates for neuropsychiatric disease, including BCL2L11, ANAPC1, and MERTK. Intrafamilial genetic heterogeneity and "second hits" in one family may have been the consequence of assortative mating. Clinical genetic testing for the 2q13 duplication and the associated genetic counseling was well received. In summary, large rare 2q13 duplications appear to be associated with variable adult neuropsychiatric and other expression. The findings represent progress toward clinical translation of research results in schizophrenia. There are implications for other emerging genomic disorders where there is interest in lifelong expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,347
Score d'incertitude au seuil0,883

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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