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Enregistrement W2091880795 · doi:10.1194/jlr.m800454-jlr200

Structural characterization of Bordetella parapertussis lipid A

2008· article· en· W2091880795 sur OpenAlexaff
Asmaa El Hamidi, А. В. Новиков, Doris Karibian, Malcolm B. Perry, Martine Caroff

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLipid AVirulence factorBordetella pertussisChemistryAcylationStrain (injury)BordetellaBiochemistryDisaccharideStereochemistryBacteriaVirulenceMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bordetella parapertussis like B. pertussis, is a causal agent of whooping cough but is not a strictly human pathogen. Because its endotoxin, a major structural component of the Gram-negative outer membrane, is an important virulence factor, we have analyzed the structure of its toxic lipid domain, in one rough and two smooth bacterial strains. Chemical analyses and mass spectra obtained before and after recently developed mild-alkali treatments revealed that the lipids A have the common bisphosphorylated beta-(1-->6)-linked D-glucosamine disaccharide with hydroxytetradecanoic acid in amide linkages. All three strains have two major molecular species: a tetraacyl and a pentaacyl species. The rough strain is richer in a minor hexaacyl species. Acylation at the C-2, C-3, and C-3' positions was different from that of the B. pertussis lipid A. The C-2 position carries a secondary hexadecanoic acid, the C-3 position is free, and the C-3' position is substituted with hydroxydecanoic acid (not at C-3 as in B. pertussis), and the rough strain hexaacyl species carries a second secondary hexadecanoic acid. Like the lipid A of B. pertussis, the hydroxytetradecanoic acid at the C-2' position was substituted by tetradecanoic acid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,456
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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