Demographic history and interspecific hybridization of four<i>Shorea</i>species (Dipterocarpaceae) from Peninsular Malaysia inferred from nucleotide polymorphism in nuclear gene regions
Notice bibliographique
Résumé
Shorea acuminata Dyer, Shorea curtisii Dyer ex King, Shorea leprosula Miq., and Shorea parvifolia Dyer are dominant tree species in the tropical rainforest of Peninsular Malaysia, which experienced several climatic changes during Pleistocene. To investigate the current population structure and demographic history of these species, we analyzed levels and patterns of nucleotide polymorphism of the nuclear gene region PgiC. We also used sequence data of the GapC gene region obtained in our previous study. Negative Tajima’s D values observed in both investigated gene regions for S. curtisii, S. leprosula, and S. parvifolia implied that all three species have experienced population expansion events. Little to moderate levels of population differentiation in S. acuminata and S. curtisii suggested recent divergence of the investigated populations after postglacial colonization of the Peninsular Malaysia. In addition, some haplotypes were similar or identical to haplotypes of the other species. The existence of such haplotypes could be partially explained by interspecific hybridization. Indeed, we found some putative hybrid individuals. Interspecific hybridization among closely related species might have contributed to the polymorphism of the investigated species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».