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Enregistrement W2091977946 · doi:10.1158/1535-7163.pms-a02

Abstract A02: PARP inhibition selectively kills RNF20-depleted cells

2013· article· en· W2091977946 sur OpenAlexaff
Brent J. Guppy, Kirk J. McManus

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomologous recombinationBiologyDNA repairGenome instabilityCancer cellMolecular biologyDNA damageChromosome instabilityCancer researchChromosomeCancerGeneGeneticsCell biologyDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chromosomal instability (CIN) is an early event that drives the development of tumors and it is associated with virtually all tumor types. CIN is defined as an increase in the rate at which whole chromosomes or large parts thereof, are gained or lost. Consequently, CIN drives large-scale genomic changes, which has adverse consequences for oncogenes and tumor suppressor genes that localize to those altered regions. Genes that normally function to maintain chromosome stability are often found altered in human cancers. As a result, synthetic lethal strategies designed to target cancer cells harboring defects in chromosome stability genes has potential broad-spectrum applicability. RNF20, a histone H2B mono-ubiquitin ligase, is one such chromosome stability gene that is frequently found mutated in various cancers. The prevalence of cancer-associated RNF20 mutations across multiple tumor types and its role in homologous recombination repair makes RNF20 an attractive target for therapeutic intervention. Previous groups have shown that cells harboring defects in homologous recombination repair proteins (BRCA1/2) can be specifically killed through PARP inhibition. As a result, we hypothesized that RNF20-depleted cancer cells may be targeted in a similar manner. Consistent with the hallmarks of CIN, siRNF20 and flow cytometry revealed increases in DNA content compared to controls. In addition, indirect immunofluorescent imaging demonstrated the appearance of micronuclei and lagging chromosomes in RNF20-silenced populations. We subsequently showed that RNF20-depleted cells exhibit defects in homologous recombination repair through delayed repair kinetics as indicated by the persistence of γH2AX and 53BP1 foci. Using real-time cell analyses and RNAi, we show that simultaneous silencing of RNF20 and PARP can specifically kill these populations compared to RNF20-silenced plus GAPDH-silenced controls. In addition, specific killing was recapitulated using Olaparib (a chemical PARP inhibitor) in combination with RNF20 knockdown. Consistent with real-time cell analysis data, we show a reduced number of viable cells in RNF20 and PARP-silenced populations and RNF20-silenced and PARP inhibited populations. To evaluate the underlying mechanism accounting for the cell cytotoxicity detailed above, Western blot analyses and immunofluorescent imaging revealed activated Caspase-3 and suggests an apoptotic response. Our data suggests that RNF20 is a CIN gene that when downregulated, can be selectively targeted and killed by either silencing or inhibiting PARP. Using a synthetic lethality strategy we have identified a candidate drug target with potential broad spectrum applicability across multiple tumor types. Citation Format: Brent J. Guppy, Kirk J. McManus. PARP inhibition selectively kills RNF20-depleted cells. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Precision Medicine Series: Synthetic Lethal Approaches to Cancer Vulnerabilities; May 17-20, 2013; Bellevue, WA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2013;12(5 Suppl):Abstract nr A02.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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