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Enregistrement W2092030376 · doi:10.1021/pr800082a

Antibody Microarray Analyses of Signal Transduction Protein Expression and Phosphorylation during Porcine Oocyte Maturation

2008· article· en· W2092030376 sur OpenAlexaff
Steven Pelech, Lucie Jelínková, Andrej Šušor, Hong Zhang, Xiaoqing Shi, A. Pavlok, Michal Kubelka, Hana Kovářová

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensKinexus Bioinformatics Corporation (Canada)University of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGerminal vesiclePhosphorylationBiologyProtein phosphorylationOocyteKinaseCell biologyPhosphataseMolecular biologySignal transductionProtein kinase AEmbryo

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Kinex antibody microarray analyses was used to investigate the regulation of 188 protein kinases, 24 protein phosphatases, and 170 other regulatory proteins during meiotic maturation of immature germinal vesicle (GV+) pig oocytes to maturing oocytes that had completed meiosis I (MI), and fully mature oocytes arrested at metaphase of meiosis II (MII). Increases in apparent protein levels of protein kinases accounted for most of the detected changes during the GV to MI transition, whereas reduced protein kinase levels and increased protein phosphorylation characterized the MI to MII transition. During the MI to MII period, many of the MI-associated increased levels of the proteins and phosphosites were completely or partially reversed. The regulation of these proteins were also examined in parallel during the meiotic maturation of bovine, frog, and sea star oocytes with the Kinex antibody microarray. Western blotting analyses confirmed altered expression levels of Bub1A, IRAK4, MST2, PP4C, and Rsk2, and the phosphorylation site changes in the kinases Erk5 (T218 + Y220), FAK (S722), GSK3-beta (Y216), MEK1 (S217 + S221) and PKR1 (T451), and nucleophosmin/B23 (S4) during pig oocyte maturation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,387
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,108
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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