Analysis of NKp30/NCR3 isoforms in untreated HIV-1-infected patients from the ANRS SEROCO cohort
Notice bibliographique
Résumé
Natural killer (NK) cells play a prominent role at the intersection between innate and cognate immunity, thus influencing the development of multiple pathological conditions including HIV-1-induced AIDS. Not only NK cells directly kill HIV-1-infected cells, but also control the maturation and/or elimination of dendritic cells (DCs). These functions are regulated by the delicate balance between activating and inhibiting receptors expressed at the NK-cell surface. Among the former, NKp30 has raised significant interest since the alternative splicing of its intracellular domain leads to differential effector functions, dictating the prognosis of patients bearing gastrointestinal sarcoma, and B7-H6 has recently been identified as its main ligand. Since NKp30 is downregulated in CD56-/CD16+ NK cells expanded in viremic, chronically infected HIV-1+ patients, we decided to investigate the predictive value of NKp30 splice variants for spontaneous disease progression in 89 therapy-naïve HIV-1-infected individuals enrolled in an historical cohort of patients followed since diagnosis (ANRS SEROCO cohort). We found no difference in the representation of NK-cell subsets (CD56bright, CD56dim, CD56neg) in HIV-1-infected patients as compared with healthy subjects. NKp30 downregulation was detected in CD56dim and CD56neg NK-cell subsets, yet this did not convey any prognostic value. None of the NKp30 isoforms did affect disease progression, as measured in terms of time-to-loss of circulating CD4+ T cells, time-to-AIDS-defining events and overall survival. NKp30 isoforms do not seem to play a major role in the outcome of HIV-1 infection, but the heterogeneity of the immuno-virological status of patients at enrollment could have to be taken into account.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».