MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2092104016 · doi:10.1359/jbmr.2003.18.5.844

Distinct Phases of Coordinated Early and Late Gene Expression in Growth Plate Chondrocytes in Relationship to Cell Proliferation, Matrix Assembly, Remodeling, and Cell Differentiation

2003· article· en· W2092104016 sur OpenAlexaff
Elena V. Tchetina, F. Mwale, AR Poole

Notice bibliographique

RevueJournal of Bone and Mineral Research · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTGF-β signaling in diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityShriners Hospitals for Children - CanadaJewish General HospitalMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChondrocyteSOX9BiologyCellular differentiationGene expressionCell biologyCell growthIndian hedgehogInternal medicineEndocrinologyGeneGeneticsAnatomyCartilageMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although much has been learned about growth plate development and chondrocyte gene expression during cellular maturation and matrix remodeling in the mouse, there has been a limited study of the interrelationships of gene expression between proteinases, growth factors, and other regulatory molecules in the mouse and in other species. Here we use RT-PCR of sequential transverse sections to examine the expression profiles of genes involved in chondrocyte growth, differentiation, matrix assembly, remodeling, and mineralization in the bovine proximal tibial growth plate. Specifically, we studied the expression of genes encoding COL2A1 and COL10A1, the latter a marker of cellular hypertrophy, the matrix metalloproteinases (MMP), MMP-13 and MMP-9, as well as the transcriptional factors, Sox9 and Cbfa1, the growth factors basic fibroblast growth factor (bFGF), parathyroid hormone-related peptide (PTHrP), transforming growth factor (TGF)beta1, and beta2, Indian hedgehog (Ihh), and the matrix protein osteocalcin. These were analyzed in relationship to cell division defined by cyclin B2 expression. Two peaks of gene expression activity were observed. One was transient, limited, and located immediately before and at the onset of cyclin B2 expression in the early proliferative zone. The other was generally much more pronounced and was located in the early hypertrophic zone. The upregulation of expression of COL2A1, its transcriptional activator Sox9, osteocalcin, MMP-13, and TGFbeta2 was observed immediately before and at the onset of cyclin B2 expression and also in the hypertrophic zones. The upregulation of COL10A1, Cbfa1, MMP-9, TGFbeta-1, and Ihh gene expression was associated exclusively with the terminal differentiation of chondrocytes at the time of mineral formation in the extracellular matrix. In contrast, bFGF and PTHrP expression was observed in association with the onset of cyclin B2 expression and hypertrophy. This initial cluster of gene expression associated predominantly with matrix assembly and onset of cell proliferation is therefore characterized by expression of regulatory molecules distinct from those involved at hypertrophy. Together these results identify separate phases of coordinated gene expression associated with the development of the physis in endochondral bone formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,287

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Bone and Mineral ResearchMême sujetTGF-β signaling in diseasesTravaux en français237 207