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Enregistrement W2092259583 · doi:10.1074/jbc.m301777200

A Novel Method to Measure Self-association of Small Amphipathic Molecules

2003· article· en· W2092259583 sur OpenAlex
Darin L. Lee, Colin T. Mant, Robert S. Hodges

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAnalytical Chemistry and Chromatography
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésAnalyteChromatographyChemistrySize-exclusion chromatographyElutionSmall moleculeAnalytical Chemistry (journal)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biophysical techniques such as size-exclusion chromatography, sedimentation equilibrium analytical ultracentrifugation, and non-denaturing gel electrophoresis are the classical methods for determining the self-association of molecules into dimers, trimers, or other higher order species. However, these techniques usually require high (mg/ml) loading concentrations to detect self-association and also possess a lower size limit that is dependent on the ability of the technique to resolve monomeric from higher order species. Here we describe a novel, sensitive method with no upper or lower molecular size limits that indicates self-association of molecules driven together by the hydrophobic effect under aqueous conditions. "Temperature profiling in reversed-phase chromatography" analyzes the retention behavior of a sample over the temperature range of 5-80 degrees C during gradient elution reversed-phase high-performance liquid chromatography. Because this technique greatly increases the effective concentration of analyte upon adsorption to the column, it is extremely sensitive, requiring very small sample quantities (microgram or less). In contrast, the classical techniques mentioned above decrease the effective analyte concentration during analysis, decreasing sensitivity by requiring larger amounts of analyte to detect molecular self-association. We demonstrate the utility of this technique with 14-residue cyclic and linear cationic peptides (<2000 Da) based on the sequence of the de novo-designed cytolytic peptide, GS14. The only requirements for the analyte molecule when using this technique are its ability to be retained on the reversed-phase column and to be subsequently removed from the column during gradient elution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,731

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle