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Enregistrement W2092444700 · doi:10.3389/fpls.2013.00059

mRNA export: threading the needle

2013· article· en· W2092444700 sur OpenAlexaff
Ouassila Gaouar, Hugo Germain

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThreading (protein sequence)Messenger RNABusinessBiologyInternational tradeGeneGeneticsBiochemistryProtein structure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

After mRNA biogenesis, several proteins interact with the messenger to ensure its proper export to the cytoplasm. Some of these proteins will bind RNA early on, at the onset of transcription by RNA polymerase II holoenzyme, while others will join later for downstream processing steps, such as poly-adenylation or splicing, or may direct mRNA ribonucleoprotein particle migration to the nucleopore. We recently discovered that Arabidopsis plant knockout for the protein MOS11 (MODIFIER OF SNC1, 11) partially suppresses autoimmune responses observed in the TNL-type [TIR/NBS/LRR (Toll-interleukin-like receptor/nucleotide-binding site/C-terminal leucine-rich repeat)] R gene gain-of-function variant snc1 (suppressor of npr1-1, constitutive 1). This suppression of resistance to pathogens appears to be caused by a decrease in nuclear mRNA export in mos11-1 snc1 plants. In humans, the putative ortholog of MOS11, CIP29 (29-kDa cytokine-induced protein), interacts with three proteins that are also involved in mRNA export: DDX39 (DEAD-box RNA helicase), TAF15 of the FUS family (FUSED IN SARCOMA), and ALY (ALWAYS EARLY), a protein implicated in mRNA export in mammalian systems. These proteins have received very little attention in plants. Here, we will discuss their particularities and role in mRNA export and biotic stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,332
Score d'incertitude au seuil0,148

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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