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Enregistrement W2092707882 · doi:10.1042/bj20050025

Characterization of a novel, cytokine-inducible carboxypeptidase D isoform in haematopoietic tumour cells

2005· article· en· W2092707882 sur OpenAlexafffund
Padraic O’Malley, Shirley M. Sangster, Salma A. Abdelmagid, Stephen L. Bearne, Catherine K.L. Too

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchDalhousie University
Mots-clésMolecular biologyGene isoformJurkat cellsBiologyCell cultureCytokineWestern blotK562 cellsGeneBiochemistryT cellImmunologyImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CPD-N is a cytokine-inducible CPD (carboxypeptidase-D) isoform identified in rat Nb2 T-lymphoma cells. The prototypic CPD (180 kDa) has three CP domains, whereas CPD-N (160 kDa) has an incomplete N-terminal domain I but intact domains II and III. CPD processes polypeptides in the TGN (trans-Golgi network) but the Nb2 CPD-N is nuclear. The present study identified a cryptic exon 1', downstream of exon 1 of the rat CPD gene, as an alternative transcription start site that encodes the N-terminus of CPD-N. Western-blot analysis showed exclusive synthesis of the 160 kDa CPD-N in rat Nb2 and Nb2-Sp lymphoma cells. Several haematopoietic cell lines including human K562 myeloma, Jurkat T-lymphoma and murine CTLL-2 cytotoxic T-cells express a 160 kDa CPD-immunoreactive protein, whereas mEL4 T-lymphoma cells express the 180 kDa CPD. The CPD-immunoreactive protein in hK562 cells is also nuclear and cytokine-inducible. In contrast, MCF-7 breast cancer cells express only the 180 kDa CPD, which is mainly in the TGN. CPD/CPD-N assays using substrate dansyl-L-alanyl-L-arginine show approx. 98% of CPD-N activity in the Nb2 nucleus, whereas MCF-7 CPD activity is enriched in the post-nuclear 10000 g pellet. The K(m) for CPD-N and CPD are 132+/-30 and 63+/-9 microM respectively. Specific activity/K(m) ratios show that dansyl-L-alanyl-L-arginine is a better substrate for CPD-N than for CPD. CPD-N has an optimal pH of 5.6 (due to domain II), whereas CPD has activity peaks at pH 5.6 (domain II) and pH 6.5-7.0 (domain I). CPD and CPD-N are inhibited non-competitively by zinc chelator 1,10-phenanthroline and competitively by peptidomimetic inhibitor DL-2-mercaptomethyl-3-guanidinoethylthiopropanoic acid. The Nb2 CPD-N co-immunoprecipitated with phosphatase PP2A (protein phosphatase 2A) and alpha4 phosphoprotein. In summary, a cytokine-inducible CPD-N is selectively expressed in several haematopoietic tumour cells. Nuclear CPD-N is enzymatically active and interacts with known partners of CPD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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