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Enregistrement W2092746643 · doi:10.1111/j.1574-6941.2002.tb00949.x

Temporary loss of antibiotic resistance by marked bacteria in the rhizosphere of spruce seedlings

2002· article· en· W2092746643 sur OpenAlexafffund
James D. Nairn, C. P. Chanway

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRhizosphereBiologyPseudomonas fluorescensRhizobacteriaBacteriaMicrobiologyAgarPopulationAntibioticsPseudomonasHorticultureBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Survival and persistence of two plant growth-promoting rhizobacteria strains in the rhizosphere of young spruce seedlings were evaluated in field plots and soil microcosms. Bacillus polymyxa strain Pw-2R and Pseudomonas fluorescens strain Sw5-RN are spontaneous antibiotic-resistant derivatives of the naturally occurring parental strains B. polymyxa Pw-2 and P. fluorescens Sw5, respectively. Resistance to 200 microg ml(-1) rifamycin in strain Pw-2R, and to 100 microg ml(-1) each of rifamycin and nalidixic acid in Sw5-RN, facilitated monitoring of these bacteria in rhizosphere samples. Strains Pw-2R and Sw5-RN were each inoculated into the rhizosphere of spruce seedlings in field plots as well as in intact soil core microcosms that were incubated under controlled environmental conditions. Bacterial survival data based on the abilities of Pw-2R and Sw5-RN to be re-isolated from rhizosphere samples, and by growing on agar containing antibiotics, were collected over a 2-year period as part of a larger study. The population sizes of both bacterial strains appeared to drop below detection limits by the beginning of the second year as they failed to grow on primary isolation media containing antibiotics. However, strains Pw-2R and Sw5-RN grew on isolation medium with antibiotics if they were first isolated on agar without antibiotics and then replica-plated onto agar media containing antibiotics. A similar temporary loss of antibiotic resistance has been observed with endophytic bacteria, but our results suggest such masking may be of much wider significance than previously thought. If it commonly occurs in rhizosphere colonizing bacteria as well as endophytes, significant underestimates of bacterial population sizes in similar environmental samples may result.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,801
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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