P16-27.Optimization of the expansion of antigen-specific CD8+ T-cells for use in a viral suppression assay
Notice bibliographique
Résumé
CD8+ T-cells have long been shown to be important for control of HIV-1 infection, though it is clear that not all CD8+ T-cell responses are equal. For the best chance of producing a successful vaccine, it is crucial to define which responses lead to better disease outcomes. Many studies have correlated HIV-specific T-cell responses with slower HIV disease progression; however, a causal relationship has not been clearly defined. Tetramers to antigen-specific cells allow enumeration, characterization and separation of cell populations, allowing comparison of their viral suppressive capabilities in downstream assays. Tetramers were used to enumerate HIV-1 antigen-specific CD8+ T-cells in PBMCs from HIV infected subjects, on a BD LSR-II flow cytometer. A protocol for expansion of these epitope-specific cells was developed in control samples using the CMV peptide NLVPMVATV due to its immunodominance in North America. Cells were stimulated for 10 days with varying concentrations of IL-2, IL-7 and IL-15 along with the tetramer-matched peptide to elucidate optimal expansion conditions. Initially, ~0.5%–1.5% of CD8+ T-cells bound to HIV-1 specific tetramers in HIV-1 infected subjects. These low cell numbers identified a need for expansion of the cells for use in downstream assays. In our protocol, addition of IL-15 and peptide results in an increase of tetramer+ cells from 3.5% to 85% of total CD8+ T-cells, while IL-2 and IL-7-induced responses were less robust. Increasing the concentrations or adding multiple cytokines at once decreased the population of tetramer+ T-cells to less than 1%. These results indicate that antigen-specific T-cells can be expanded to high levels for use in subsequent assays, such as a study of their HIV-1 suppressive capabilities. This will provide a direct link between specific CD8+ T-cells and viral control, which will be key in determining which responses are most likely to be effective in an HIV-1 vaccine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».