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Enregistrement W2092754141 · doi:10.1186/1742-4690-6-s3-p256

P16-27.Optimization of the expansion of antigen-specific CD8+ T-cells for use in a viral suppression assay

2009· article· en· W2092754141 sur OpenAlexaff
MM Herman, Lyle R. McKinnon, AF Meyers, SA Koesters, Joshua Kimani, FA Plummer, T. Blake Ball

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCD8AntigenImmunologyVirologyCytotoxic T cellAntibodyHuman immunodeficiency virus (HIV)T cellDiseaseCellMedicineBiologyImmune systemGeneticsInternal medicineIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD8+ T-cells have long been shown to be important for control of HIV-1 infection, though it is clear that not all CD8+ T-cell responses are equal. For the best chance of producing a successful vaccine, it is crucial to define which responses lead to better disease outcomes. Many studies have correlated HIV-specific T-cell responses with slower HIV disease progression; however, a causal relationship has not been clearly defined. Tetramers to antigen-specific cells allow enumeration, characterization and separation of cell populations, allowing comparison of their viral suppressive capabilities in downstream assays. Tetramers were used to enumerate HIV-1 antigen-specific CD8+ T-cells in PBMCs from HIV infected subjects, on a BD LSR-II flow cytometer. A protocol for expansion of these epitope-specific cells was developed in control samples using the CMV peptide NLVPMVATV due to its immunodominance in North America. Cells were stimulated for 10 days with varying concentrations of IL-2, IL-7 and IL-15 along with the tetramer-matched peptide to elucidate optimal expansion conditions. Initially, ~0.5%–1.5% of CD8+ T-cells bound to HIV-1 specific tetramers in HIV-1 infected subjects. These low cell numbers identified a need for expansion of the cells for use in downstream assays. In our protocol, addition of IL-15 and peptide results in an increase of tetramer+ cells from 3.5% to 85% of total CD8+ T-cells, while IL-2 and IL-7-induced responses were less robust. Increasing the concentrations or adding multiple cytokines at once decreased the population of tetramer+ T-cells to less than 1%. These results indicate that antigen-specific T-cells can be expanded to high levels for use in subsequent assays, such as a study of their HIV-1 suppressive capabilities. This will provide a direct link between specific CD8+ T-cells and viral control, which will be key in determining which responses are most likely to be effective in an HIV-1 vaccine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,299

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
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