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Enregistrement W2092768194 · doi:10.1111/j.1365-3059.2005.01155.x

Distribution and properties of geographically distinct isolates of sugar beet yellowing viruses

2005· article· en· W2092768194 sur OpenAlexaff
Mark I. Stevens, Nicola J. Patron, Christine A. Dolby, Rebecca Weekes, P. B. Hallsworth, Olivier Lemaire, H. G. Smith

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyClosterovirusSugar beetPlant virusVirologyVirusSequence analysisCoat proteinBotanyGeneticsGeneHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

From a total of 261 yellow sugarbeet leaves collected from 10 countries representing three continents, the incidence and distribution of strains of Beet mild yellowing virus (BMYV), Beet chlorosis virus (BChV) and Beet yellows virus (BYV) were analysed using serological and molecular methods. BMYV was found in all countries except Greece, and more frequently in the northern and western areas of Europe, whereas BYV predominated in Turkey, Spain, Greece, the USA and Chile. BChV, originally found in the USA and the UK in 1989, was identified in France, Spain, the Netherlands and Chile. Nine sugar beet poleroviruses, plus a reference isolate of Turnip yellows virus (TuYV, syn. Beet western yellows virus ), were further characterized and compared. Isolates obtained from sugar beet infected this species, but not oilseed rape or lettuce; all isolates except one infected Capsella bursa‐pastoris . The coat‐protein sequences of these isolates were highly similar, with the consensus sequence representing 89% of nucleotide residues. Within the coat‐protein gene, two regions were identified that could represent specific epitopes to which monoclonal antibody BYDV‐PAV‐IL‐1 could bind; this antibody is used to distinguish beet poleroviruses in ELISA. Comparison of the sequences at the 5′ end showed that sequence homology existed only between isolates with the same host range. The first sequence data of polerovirus isolates from Chile are presented, showing that the coat protein and the 5′ end of their genomes are highly similar to those of BMYV isolates found in Europe. Chilean polerovirus isolates may have been imported from the northern hemisphere in sugar beet breeding material.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,627
Score d'incertitude au seuil0,129

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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