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Enregistrement W2092796013 · doi:10.1139/w04-107

Characteristics of the rhizobia associated with <i>Dalea</i> spp. in the Ordway, Kellogg–Weaver Dunes, and Hayden prairies

2005· article· en· W2092796013 sur OpenAlexvenueno aff
Becki Tlusty, Peter van Berkum, Peter Graham

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRhizobiaBiologyFabaceaeBotanyEcologySymbiosisPaleontologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Habitat fragmentation affects the biodiversity and function of aboveground organisms in natural ecosystems but has not been studied for effects on belowground species. In this paper, we consider the diversity of the rhizobia associated with the indigenous legume Dalea purpurea in 3 residual prairie areas in Minnesota and Iowa. Using Dalea purpurea as a trap host, 218 rhizobia were recovered from these soils then characterized using BOXA1R PCR. Three major and 13 minor groups were distinguished based on a similarity of greater than 75% in fingerprint patterns. Each major group consisted almost exclusively of rhizobia from a single prairie, with the diversity of Dalea rhizobia recovered from the Hayden Prairie less than that obtained with rhizobia from the other prairies. Based on 16S rRNA gene sequence analysis, isolates from the Hayden, Ordway, and Kellogg-Weaver Dunes prairies were most similar to Rhizobium etli and Rhizobium leguminosarum, Rhizobium gallicum, and Mesorhizobium amorphae and Mesorhizobium huakuii, respectively. This variation in the dominant microsymbiont species across the 3 prairies studied was unexpected but could have been influenced by the limited number of samples that we were allowed to take, by unanticipated cross-nodulation between native legumes, and by variation in the range of legume species present in each residual prairie area. While some of the rhizobia from Dalea nodulated Phaseolus vulgaris, Macroptilium atropurpureum, Leucaena leucocephala, and Onobrychis viciifolia in addition to the Dalea species tested, others nodulated Astragalus canadensis or Amorpha canescens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,166
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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