Characteristics of the rhizobia associated with <i>Dalea</i> spp. in the Ordway, Kellogg–Weaver Dunes, and Hayden prairies
Notice bibliographique
Résumé
Habitat fragmentation affects the biodiversity and function of aboveground organisms in natural ecosystems but has not been studied for effects on belowground species. In this paper, we consider the diversity of the rhizobia associated with the indigenous legume Dalea purpurea in 3 residual prairie areas in Minnesota and Iowa. Using Dalea purpurea as a trap host, 218 rhizobia were recovered from these soils then characterized using BOXA1R PCR. Three major and 13 minor groups were distinguished based on a similarity of greater than 75% in fingerprint patterns. Each major group consisted almost exclusively of rhizobia from a single prairie, with the diversity of Dalea rhizobia recovered from the Hayden Prairie less than that obtained with rhizobia from the other prairies. Based on 16S rRNA gene sequence analysis, isolates from the Hayden, Ordway, and Kellogg-Weaver Dunes prairies were most similar to Rhizobium etli and Rhizobium leguminosarum, Rhizobium gallicum, and Mesorhizobium amorphae and Mesorhizobium huakuii, respectively. This variation in the dominant microsymbiont species across the 3 prairies studied was unexpected but could have been influenced by the limited number of samples that we were allowed to take, by unanticipated cross-nodulation between native legumes, and by variation in the range of legume species present in each residual prairie area. While some of the rhizobia from Dalea nodulated Phaseolus vulgaris, Macroptilium atropurpureum, Leucaena leucocephala, and Onobrychis viciifolia in addition to the Dalea species tested, others nodulated Astragalus canadensis or Amorpha canescens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».