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Enregistrement W2092934126 · doi:10.1111/j.1462-5822.2007.01028.x

The bundlin pilin protein of enteropathogenic Escherichia coli is an N-acetyllactosamine-specific lectin

2007· article· en· W2092934126 sur OpenAlexafffund
Romney M. Hyland, Jiangxiao Sun, Thomas P. Griener, George L. Mulvey, John S. Klassen, Michael S. Donnenberg, Glen D. Armstrong

Notice bibliographique

RevueCellular Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Glycomics Centre
Mots-clésBacterial adhesinRecombinant DNABiologyEscherichia coliPilusEnteropathogenic Escherichia coliLectinGlycosylationMolecular biologyMicrobiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synthetic N-acetyllactosamine (LacNAc) glycoside sequences coupled to BSA competitively inhibit enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) localized adherence (LA) to human intestinal biopsy specimens and tissue culture cell monolayers. The LacNAc-specific adhesin appears to be associated with the bundle-forming pili (BFP) expressed by EPEC during the early stages of colonization. Herein, we report that recombinant bundlin inhibits EPEC LA to HEp-2 cells and binds to HEp-2 cells. Recombinant bundlin also binds, with millimolar association constants (K(assoc)), to synthetic LacNAc-Benzene and LacNAc-O(CH(2))(8)CONH(2) glycosides as assessed in the gas phase by nanoelectrospray ionization mass spectrometry. Furthermore, LacNAc-BSA inhibits LA only of EPEC strains that express alpha bundlin alleles, suggesting putative locations for the LacNAc-binding pocket in the alpha bundlin monomer. Collectively, these results suggest that alpha bundlin possesses lectin-like properties that are responsible for LacNAc-specific initial adherence of alpha bundlin-expressing EPEC strains to host intestinal epithelial cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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