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Enregistrement W2092938351 · doi:10.1118/1.4735848

MO‐G‐BRA‐03: Semi‐Automatic Segmentation of the Prostate Midgland in Magnetic Resonance Images Using Shape and Local Appearance Similarity Analysis

2012· article· en· W2092938351 sur OpenAlexaff
Maysam Shahedi, Aaron Fenster, Cesare Romagnoli, Aaron D. Ward

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMedical Imaging and Analysis
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSegmentationSimilarity (geometry)Artificial intelligenceMagnetic resonance imagingImage segmentationPattern recognition (psychology)MathematicsBoundary (topology)Computer scienceRADIUSProstateGround truthNuclear medicineComputer visionImage (mathematics)MedicineMathematical analysisRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose : To design, develop and test a semi‐automatic segmentation method for the prostate midgland on T2W magnetic resonance (MR) images acquired using an endorectal (ER) coil, based on inter‐subject prostate shape and local boundary appearance similarity.Method and Materials: We used T2W prostate MR images of 33 subjects acquired using an ER coil. From each image, we extracted the closest mid‐gland axial slice to the verumontanum. We partitioned the images into training and test sets using leave‐one‐out cross‐validation. We used the training images to define a point distribution model (PDM) describing shape variability as well as 36 circular ‘mean intensity patches' characterizing the inter‐subject local appearance at anatomically‐defined boundary locations. We chose a patch radius of 17mm based on our assessment of segmentation error, using the mean absolute boundary distance (MAD), on a subset of 13 images during a systematic radius search from 5mm to 25mm. For each test image, we defined 36 homologous rays emanating from the centre of the prostate. We used a radial‐based‐search strategy to translate each mean intensity patch along its corresponding ray and computed the normalized cross‐correlation (NCC) between the mean patch and the underlying patch in the test image at each point. We chose the point with the highest NCC along each ray. We then used the PDM to regularize the selected points. To compare the algorithm's segmentation to manual delineations performed by one operator, we calculated the MAD and Dice similarity coefficient (DSC). Results : We measured a MAD of 1.6 +/− 1.0mm, and a DSC of 89 +/− 6% between the semi‐automatically segmented contours and the manually‐delineated reference standard. Conclusions : NCC of local prostate boundary regions with a learned mean boundary appearance may be suitable for boundary localization and subsequent refinement using a PDM on T2W MR images acquired using an ER coil.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,897
Score d'incertitude au seuil0,348

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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