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Enregistrement W2092993299 · doi:10.1152/ajprenal.0092.2001

Murine and human type I Na-phosphate cotransporter genes: structure and promoter activity

2001· article· en· W2092993299 sur OpenAlexaff
Youssouf Soumounou, Claude Gauthier, Harriet S. Tenenhouse

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Renal Physiology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyCAAT boxPromoterBiologyGeneTATA boxExonTranscription factorReporter geneTranscription (linguistics)TransfectionGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Na-phosphate (P(i)) cotransporters in the apical membrane of renal proximal tubular cells play a major role in the maintenance of P(i) homeostasis. Although two such cotransporters, Npt1 and Npt2, have been identified, little is known about the function and regulation of Npt1. We cloned and characterized the murine (Npt1) and human (NPT1) genes, isolated the 5'-flanking region of Npt1, and analyzed its promoter activity. Npt1 is approximately 29 kb with 12 exons, whereas NPT1 is approximately 49 kb with one additional exon. The Npt1 promoter has a TATA-like box but no CAAT box, and the transcription start site was identified by primer extension and 5'-rapid amplification of cDNA ends. Transfection of opossum kidney cells with Npt1 promoter-reporter gene constructs demonstrated significant activity in a 570-bp fragment that was completely inhibited by cotransfection with the transcription factor, hepatocyte nuclear factor (HNF)-3 beta. Deletion of 200 bp from the 3'-end of the 570-bp fragment abrogated its promoter activity. In addition, promoter activity of a 4.5-kb fragment, but not the 570-bp fragment, was stimulated fourfold by cotransfection with HNF-1 alpha. Other well-characterized cis-acting elements were identified in the Npt1 promoter. We suggest that Npt1 expression is transcriptionally regulated and provide a basis for the investigation of Npt1 function by targeted mutagenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,719
Score d'incertitude au seuil0,711

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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