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Enregistrement W2093074701 · doi:10.1073/pnas.1007075107

Mechanisms of suspended animation are revealed by transcript profiling of diapause in the flesh fly

2010· article· en· W2093074701 sur OpenAlexfundno aff
Gregory J. Ragland, David L. Denlinger, Daniel A. Hahn

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of Integrative Organismal SystemsNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversity of PennsylvaniaUniversity of TorontoUniversity of FloridaU.S. Department of AgricultureNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésDiapauseBiologyDormancyFlesh flyDrosophila melanogasterTranscriptomeEvolutionary biologyPhenotypeGeneticsGeneZoologyEcologyGene expressionLarvaBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diapause is a widespread adaptation to seasonality across invertebrate taxa. It is critical for persistence in seasonal environments, synchronizing life histories with favorable, resource-rich conditions and mitigating exposure to harsh environments. Despite some promising recent progress, however, we still know very little about the molecular modifications underlying diapause. We used transcriptional profiling to identify key groups of genes and pathways differentially regulated during pupal diapause, dynamically regulated across diapause development, and differentially regulated after diapause was pharmacologically terminated in the flesh fly Sarcophaga crassipalpis. We describe major shifts in stress axes, endocrine signaling, and metabolism that accompany diapause, several of which appear to be common features of dormancy in other taxa. To assess whether invertebrates with different diapause strategies have converged toward similar transcriptional profiles, we use archived expression data to compare the pupal diapause of S. crassipalpis with the adult reproductive diapause of Drosophila melanogaster and the larval dauer of Caenorhabditis elegans. Although dormant invertebrates converge on a few similar physiological phenotypes including metabolic depression and stress resistance, we find little transcriptional similarity among dormancies across species, suggesting that there may be many transcriptional strategies for producing physiologically similar dormancy responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,233
Score d'incertitude au seuil0,290

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations214
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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