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Enregistrement W2093087258 · doi:10.3390/ijms15057213

The Association of Il28b Genotype with the Histological Features of Chronic Hepatitis C Is HCV Genotype Dependent

2014· article· en· W2093087258 sur OpenAlexaff
Roberta D’Ambrosio, Alessio Aghemo, Raffaele De Francesco, Maria Grazia Rumi, E. Galmozzi, Stella De Nicola, Cristina Cheroni, Paul J. Clark, Guido Ronchi, Pietro Lampertico, Massimo Colombo

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeChronic hepatitisHepatitis CHepacivirusMedicineVirologyHepatitis C virusImmunologyBiologyGeneticsGeneVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interleukin 28B (IL28B) rs12979860 polymorphism is associated with treatment outcome in hepatitis C virus (HCV) genotype 1 and 4 patients. Its association with the histological features of chronic hepatitis C and disease severity needs further clarifications. To assess the correlation between IL28B genotype, HCV genotype and liver biopsy findings in untreated patients. MATERIALS AND METHODS: Pre-treatment liver biopsies from 335 HCV Caucasian patients (59% males, age 50 years) enrolled in the MIST study were staged for fibrosis and inflammation according to the METAVIR and the Ishak scoring systems; steatosis was dichotomized as <5% or ≥5%. IL28B was typed by Taqman Single Nucleotide Polymorphism (SNP) genotyping assay. HCV genotype was 1 in 151 (45%), 2 in 99 (30%), 3 in 50 (15%) and 4 in 35 (10%) patients. IL28B genotype was CC in 117 (34%), CT in 166 (49%) and TT in 52 (15%). At univariate analysis, the IL28B CC genotype was associated with severe portal inflammation in HCV-1 patients (CC vs. CT/TT: 86% vs. 63%, p = 0.005), severe lobular inflammation in HCV-2 patients (CC vs. CT/TT: 44% vs. 23%, p = 0.03), and less fatty infiltration in HCV-1 patients (CC vs. CT/TT: 72% vs. 51%, p = 0.02). Despite the lack of any association between IL28B and fibrosis stage, in HCV-3 patients IL28B CC correlated with METAVIR F3-F4 (CC vs. CT/TT: 74% vs. 26%, p = 0.05). At multivariate analysis, the genotype CC remained associated with severe portal inflammation in HCV-1, only (Odds Ratio (OR): 95% Confidence Interval (CI): 3.24 (1.23-8.51)). IL28B genotype is associated with the histological features of chronic hepatitis C in a HCV genotype dependent manner, with CC genotype being independently associated with severe portal inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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