Molecular Phylogenetic Support from Ribosomal DNA Sequences for Origin of Helminthosporium from Leptosphaeria-like Loculoascomycete Ancestors
Notice bibliographique
Résumé
Internal transcribed spacer (ITS) regions and 5.8S rDNA were PCR-amplified and sequenced for 17 isolates of Helminthosporium solani, cause of the potato disease silver scurf, and for 10 other isolates obtained from culture collections as Helminthosporium spp. Of these, five isolates had been incorrectly identified as Helminthosporium spp. and belonged in the genera Cochliobolus (anamorphs Bipolaris, Curvularia), Cladosporium, and Pyrenophora (anamorph Drechslera). Sequence alignment and analyses of ITS regions and 5.8S rDNA of four true Helminthosporium species and more than 45 fungi formerly grouped in the genus Helminthosporium s. l. revealed that the segregated Helminthosporium species did not group with Helminthosporium s. s. Three species of Helminthosporium s. s. (H. solani, type species H. velutinum, and H. chlorophorae) grouped tightly and were most closely related to the teleomorph Leptosphaeria bicolor. For H. solani and H. velutinum, 18SrDNA sequences were also determined. Phylogenetic analyses of the 18S rDNA sequences of 33 euascomycetous species confirmed the close relationship of H. solani and H. velutinum to L. bicolor and placed Helminthosporium in the Pleosporales with 100% parsimony bootstrap support. Helminthosporium asterinum did not group closely with the other species of Helminthosporium s. s., but was as closely related to discomycetes in the Leotiales as to other true Helminthosporium spp. Review of type material revealed that H. asterinum could be excluded from the genus Helminthosporium based on morphology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».