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Enregistrement W2093220053 · doi:10.1093/jac/dkt025

Changes in fluoroquinolone resistance over 5 years (CANWARD 2007-11) in bacterial pathogens isolated in Canadian hospitals

2013· article· en· W2093220053 sur OpenAlexafffundabout
James A. Karlowsky, Heather J. Adam, Marc Desjardins, Philippe Lagacé‐Wiens, D. J. Hoban, George G. Zhanel, Melanie Baxter, Kimberly A. Nichol, Andrew Walkty

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of ManitobaSt. Boniface HospitalShared HealthOttawa HospitalHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesAstellas PharmaBayer CanadaMedicines CompanyAstraZenecaUniversity of ManitobaSunovionPfizerPfizer CanadaAchaogenAbbott Laboratories
Mots-clésMicrobiologyAntibiotic resistanceMedicineBiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The purpose of this study was to analyse Canadian national surveillance data, specifically fluoroquinolone resistance, from 2007 to 2011 inclusive, to determine trends in resistance over time and to assess correlations with patient demographic factors. METHODS: All isolates of Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus and Streptococcus pneumoniae collected by the 10 sites that participated in the annual CANWARD surveillance studies in each of the 5 years were included in this analysis. A multifactorial logistic regression model was used to determine the variables with significant impact on fluoroquinolone resistance. RESULTS: The proportion of E. coli isolates resistant to ciprofloxacin increased significantly (P = 0.0005) between 2007 (20.0%) and 2011 (29.2%), although similar increases were not seen in K. pneumoniae, E. cloacae, P. aeruginosa and S. pneumoniae (tested against levofloxacin) (P > 0.05). Among isolates of S. aureus, there was a significant decrease in ciprofloxacin resistance from 34.4% in 2007 to 24.6% in 2011 (P < 0.0001). Resistance to ciprofloxacin was a component of most multidrug-resistant (MDR) phenotypes for E. coli, K. pneumoniae, E. cloacae, P. aeruginosa and S. aureus. CONCLUSIONS: A significant increase in the percentage of ciprofloxacin-resistant E. coli, primarily among urine isolates, and a significant decrease in the percentage of ciprofloxacin-resistant S. aureus occurred between 2007 and 2011. Notably, MDR isolates were frequently fluoroquinolone resistant for all organisms studied, except S. pneumoniae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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