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Enregistrement W2093247768 · doi:10.1111/j.1755-0998.2008.02475.x

Characterization of 155 EST‐derived microsatellites from Atlantic cod (<i>Gadus morhua</i>) and validation for linkage mapping

2009· article· en· W2093247768 sur OpenAlexafffund
Brent Higgins, Sophie Hubert, Gary Simpson, C. Stone, Sharen Bowman

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology Resources · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesVlaamse regeringGenome AtlanticAtlantic Canada Opportunities AgencyGoddard Space Flight CenterGenome Canada
Mots-clésGadusMicrosatelliteBiologyAtlantic codMendelian inheritanceGeneticsAlleleSelection (genetic algorithm)Genetic linkageEvolutionary biologyFisheryFish <Actinopterygii>Gene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microsatellite markers for Atlantic cod (Gadus morhua) were identified from a collection of 30 630 expressed sequence tags. Primers were designed for 395 microsatellites and 155 were successfully amplified. Allele number varied from 1 to 26 (average 6.34). Average observed and expected heterozygosities were 0.50 and 0.54, respectively. A subset of 105 microsatellites tested for Mendelian segregation showed no significant distortion of segregation when correcting for multiple tests. Null alleles were detected at four loci. Significant blastx matches were found for 23 loci. These microsatellites will be used to create a linkage map to enhance genetic selection in commercial cod breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,257
Score d'incertitude au seuil0,668

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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