A novel mechanism for fine-tuning open-state stability in a voltage-gated potassium channel
Notice bibliographique
Résumé
Voltage-gated potassium channels elicit membrane hyperpolarization through voltage-sensor domains that regulate the conductive status of the pore domain. To better understand the inherent basis for the open-closed equilibrium in these channels, we undertook an atomistic scan using synthetic fluorinated derivatives of aromatic residues previously implicated in the gating of Shaker potassium channels. Here we show that stepwise dispersion of the negative electrostatic surface potential of only one site, Phe481, stabilizes the channel open state. Furthermore, these data suggest that this apparent stabilization is the consequence of the amelioration of an inherently repulsive open-state interaction between the partial negative charge on the face of Phe481 and a highly co-evolved acidic side chain, Glu395, and this interaction is potentially modulated through the Tyr485 hydroxyl. We propose that the intrinsic open-state destabilization via aromatic repulsion represents a new mechanism by which ion channels, and likely other proteins, fine-tune conformational equilibria. Voltage-gated potassium channels cycle between closed and open states through poorly-defined transitions. Pless and colleagues incorporate artificial amino acids into Shaker potassium channels and find that that the negative electrostatic surface potential of Phe481, destabilizes the channel open state.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».