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Enregistrement W2093293314 · doi:10.1158/1055-9965.epi-06-0092

Genetic Ancestry and Risk Factors for Breast Cancer among Latinas in the San Francisco Bay Area

2006· article· en· W2093293314 sur OpenAlexaff
Elad Ziv, Esther M. John, Shweta Choudhry, Jennifer Y. Kho, Wendy Lorizio, Eliseo J. Pérez‐Stable, Esteban G. Burchard

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteU.S. Department of Defense
Mots-clésGenetic genealogyBreast cancerDemographyOdds ratioAncestry-informative markerMedicineBody mass indexPopulationOverweightLogistic regressionPopulation stratificationCancerGerontologyInternal medicineAlleleAllele frequencyGeneticsBiologyGenotypeSingle-nucleotide polymorphismEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Genetic association studies using case-control designs are susceptible to false-positive and false-negative results if there are differences in genetic ancestry between cases and controls. We measured genetic ancestry among Latinas in a population-based case-control study of breast cancer and tested the association between ancestry and known breast cancer risk factors. We reasoned that if genetic ancestry is associated with known breast cancer risk factors, then the results of genetic association studies would be confounded. METHODS: We used 44 ancestry informative markers to estimate individuals' genetic ancestry in 563 Latina participants. To test whether ancestry is a predictor of hormone therapy use, parity, and body mass index (BMI), we used multivariate logistic regression models to estimate odds ratios (OR) and 95% confidence intervals (95% CI) associated with a 25% increase in Indigenous American ancestry, adjusting for age, education, and the participant's and grandparents' place of birth. RESULTS: Hormone therapy use was significantly less common among women with higher Indigenous American ancestry (OR, 0.78; 95% CI, 0.63-0.96). Higher Indigenous American ancestry was also significantly associated with overweight (BMI, 25-29.9 versus <25) and obesity (BMI, > or =30 versus <25), but only among foreign-born Latina women (OR, 3.44; 95% CI, 1.97-5.99 and OR, 1.95; 95% CI, 1.24-3.06, respectively). CONCLUSION: Some breast cancer risk factors are associated with genetic ancestry among Latinas in the San Francisco Bay Area. Therefore, case-control genetic association studies for breast cancer should directly measure genetic ancestry to avoid potential confounding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,878

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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