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Enregistrement W2093404344 · doi:10.4141/cjps07168

<i>Puroindoline</i> allele diversity in Canadian and northern US hard spring wheat varieties differing in kernel hardness

2008· article· en· W2093404344 sur OpenAlexvenueaboutno aff
M. A. Matus‐Cádiz, Curtis Pozniak, Pierre Hucl

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clésAlleleBiologyTriticum turgidumCommon wheatKernel (algebra)HorticultureCultivarAgronomyGeneMathematicsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Kernel hardness, one of the most important factors in determining the end-use suitability of wheat (Triticum aestivum L.), is largely influenced by puroindoline proteins a (PINA) and b (PINB). Soft texture is wildtype (Pina-D1a/Pinb-D1a) with hard texture being determined by either Pina-D1 gene deletion or point mutations in Pinb-D1a. The objectives of this study were to determine kernel hardness indices (HI) and Pina-D1/Pinb-D1 allelic diversity in a diverse set of 81 Canadian (representing eight wheat classes) and 49 US hard spring wheat varieties. Varieties were grouped into two experimental sets grown in replicated trials in 2004–2006 at Saskatoon, SK. Variation existed among varieties with HI means ranging from 21.7 (CDC Zorba) to 72.7 (AC Morse) in exp. 1 and from 25.0 (HY320) to 66.1 (Norlander) in exp. 2. Only AC Andrew, CDC Zorba, and Red Fife were soft kernel textured and carried the wildtype Pina-D1a/Pinb-D1a alleles. The majority of Canadian varieties were Pina-D1a/Pinb-D1b (69%), while a greater frequency of US varieties was Pina-D1b/Pinb-D1a (55%). Only four varieties, all from Quebec-based breeding programs, carried the Pinb-D1c allele. On average, varieties with the Pina-D1b allele had significantly harder kernels than those carrying the Pinb-D1b mutation. Durum wheat (T. turgidum L. var durum) varieties, included as hard-kernelled controls, possessed significantly harder kernels (average HI = 71.2) than spring wheat varieties with Pina-D1b (65.3). Varieties carrying Pina-D1b (null PINA) were harder than those carrying hardness mutations at the Pinb-D1 locus, but considerable overlap in hardness was evident among genotypic classes. This work represents the first extensive Pin genotyping combined with HI phenotyping survey of Canadian wheat varieties, which is expected to aid breeders in understanding how Pina-D1/Pinb-D1 allele composition is currently associated with kernel hardness across Canadian wheat classes. Key words: Triticum aestivum, kernel hardness, puroindolines

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,144

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,153 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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