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Enregistrement W2093439187 · doi:10.2135/cropsci2004.0543

Construction and Characterization of a BAC Library of a Cold‐Tolerant Hexaploid Wheat Cultivar

2005· article· en· W2093439187 sur OpenAlexaff
Indira Ratnayaka, Monica Båga, Brian Fowler, Ravindra N. Chibbar

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyInsert (composites)GenomeLocus (genetics)PlasmidGenomic libraryBacterial artificial chromosomePloidyGeneticsDNACultivarGenome sizeBotanyGeneBase sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A bacterial artificial chromosome (BAC) library was constructed from DNA of a commercially grown winter wheat cultivar ( Triticum aestivum L. cv. Norstar) that is highly tolerant to low temperatures (LT 50 = −24°C). The library was produced from nuclear leaf DNA that was partially digested with Hin dIII and inserted into pCC1BAC vector. In excess of 1.2 × 10 6 clones propagated in E. coli were obtained, archived in 384‐well microtitre plates and stored at −80°C. More than 97.1% of the recombinant plasmids contained inserts and were free from organelle DNA contamination. Analysis of 119 randomly isolated clones revealed insert sizes ranging from 17 to 262 kb with 26% of the inserts exceeding 100 kb. The average insert size was 75 kb and the genome coverage of the library was theoretically 5.5 times the haploid genome equivalent. This corresponds to a 99.6% probability of recovering any specific Norstar DNA sequence from the library. Screening of the library with nine simple sequence repeat (SSR) locus‐specific markers supported a >4.4‐fold genome coverage. The BAC library was gridded onto high‐density filters and will be used for isolation of genetic loci associated with cold‐tolerance and grain quality traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,332
Score d'incertitude au seuil0,158

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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