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Enregistrement W2093440679 · doi:10.1046/j.1365-313x.2003.01734.x

The <i>sfr6</i> mutant of <i>Arabidopsis</i> is defective in transcriptional activation via CBF/DREB1 and DREB2 and shows sensitivity to osmotic stress

2003· article· en· W2093440679 sur OpenAlexaff
Joy M. Boyce, Heather Knight, Michael K. Deyholos, Mark R. Openshaw, David W. Galbraith, Gareth Warren, Marc R. Knight

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArabidopsisMutantGenePromoterBiologyOsmotic shockGene expressionCell biologyGeneticsMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The sfr6 mutant of Arabidopsis displays a deficit in freezing tolerance after cold acclimation. We previously observed that the transcripts of three cold-, ABA- and drought-inducible genes, each having a C-repeat motif or the drought-responsive element (CRT/DRE) in its promoter, failed to normally accumulate in this mutant. We now report that the effects of sfr6 upon transcript levels are reflected in the levels of the encoded proteins, confirming that the cold-inducible protein expression is affected by the sfr6 mutation. Using microarray analysis, we found not only that this effect may be general to cold-inducible genes with CRT/DRE promoter elements, but also that it extends to some other genes whose promoters lack a CRT/DRE element. The role of the CRT/DRE has been empirically tested by use of a synthetic promoter, confirming that the CRT/DRE is sufficient to confer the sfr6 effect upon expression. Tolerance of osmotic stress was also found to be reduced in sfr6, consistent with a role in osmotic stress tolerance for the cold-, ABA- and drought-inducible genes whose expression is affected by the sfr6 mutation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations103
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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