A Novel Glycine Receptor β Subunit Splice Variant Predicts an Unorthodox Transmembrane Topology
Notice bibliographique
Résumé
The inhibitory glycine receptor is a ligand-gated ion channel with a pentameric assembly from ligand binding alpha and structural beta subunits. In addition to alpha subunit gene variants (alpha1-alpha4) and developmental alterations in subunit composition of the receptor protein complex, alternative splicing of alpha subunits has been found to contribute to glycine receptor heterogeneity. Here, we describe a novel splice variant of the glycine receptor beta subunit from mouse central nervous system, prevailing in macroglial cells, predominantly in astrocytes and extraneural tissues. As predicted by its cDNA sequence, the novel subunit betaDelta7 lacks amino acid positions 251-302 encoded by exon 7 of the Glrb gene. Transcripts and antigen of betaDelta7 were detected in cerebral cortex, liver, and heart. Lack of exon 7 results in a profoundly altered prediction of transmembrane topology as betaDelta7 lacks TM1 and TM2 present in the full-length variant. Despite these topological alterations, in vitro studies showed that the betaDelta7 polypeptide integrates into the plasma membrane, forming receptor complexes with the alpha1 subunit and gephyrin. Our data demonstrate that a topology deviating from the classical four transmembrane-fold is compatible with formation of glycine receptor protein complexes. However, co-expression of alpha1 with betaDelta7 subunits did not change glycine receptor channel properties. Rather, the high level of expression in non-neuronal cells having intimate contact with synaptic regions may account for a yet unknown function of this splice variant betaDelta7 in glycinergic neurotransmission.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».