MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2093557227 · doi:10.1074/jbc.m113.476135

The Impact of Nitric Oxide Toxicity on the Evolution of the Glutathione Transferase Superfamily

2013· article· en· W2093557227 sur OpenAlexaff
Alessio Bocedi, Raffaele Fabrini, Andrea Farrotti, Lorenzo Stella, Albert J. Ketterman, Jens Z. Pedersen, Nerino Allocati, Peter C. K. Lau, Stephan Große, Lindsay D. Eltis, Antonio C. Ruzzini, Thomas E. Edwards, Laura Morici, Erica Del Grosso, Leonardo Guidoni, Daniele Bovi, Mario Lo Bello, Giorgio Federici, Michael W. Parker, Philip G. Board, Giorgio Ricci

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaMcGill UniversityNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilState Government of VictoriaMahidol UniversityEuropean Commission
Mots-clésGlutathioneSerineGlutathione S-transferaseCysteineBiochemistryChemistryTransferaseTyrosineEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glutathione transferases (GSTs) are protection enzymes capable of conjugating glutathione (GSH) to toxic compounds. During evolution an important catalytic cysteine residue involved in GSH activation was replaced by serine or, more recently, by tyrosine. The utility of these replacements represents an enigma because they yield no improvements in the affinity toward GSH or in its reactivity. Here we show that these changes better protect the cell from nitric oxide (NO) insults. In fact the dinitrosyl·diglutathionyl·iron complex (DNDGIC), which is formed spontaneously when NO enters the cell, is highly toxic when free in solution but completely harmless when bound to GSTs. By examining 42 different GSTs we discovered that only the more recently evolved Tyr-based GSTs display enough affinity for DNDGIC ( K D < 10 −9 m) to sequester the complex efficiently. Ser-based GSTs and Cys-based GSTs show affinities 10 2 –10 4 times lower, not sufficient for this purpose. The NO sensitivity of bacteria that express only Cys-based GSTs could be related to the low or null affinity of their GSTs for DNDGIC. GSTs with the highest affinity (Tyr-based GSTs) are also over-represented in the perinuclear region of mammalian cells, possibly for nucleus protection. On the basis of these results we propose that GST evolution in higher organisms could be linked to the defense against NO. Background: Why do ancestral GSTs utilize cysteine/serine as catalytic residues, whereas more recently evolved GSTs utilize tyrosine? Results: Only the more recently evolved GSTs display enough affinity to bind and make harmless the toxic DNDGIC (a natural NO carrier). Conclusion: GST evolution could be linked to the defense against NO. Significance: This represents a further piece in the puzzle of evolutive adaptation to NO toxicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetGlutathione Transferases and PolymorphismsTravaux en français237 207