MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2093585732 · doi:10.1089/gtmb.2009.0082

An Unusual Melting Curve on a LightCycler Due to a New Mutation in Methylenetetrahydrofolate Reductase

2009· article· en· W2093585732 sur OpenAlex
Brian M. Gilfix

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenetic Testing and Molecular Biomarkers · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensRoyal Victoria Hospital
Organismes subventionnairesMcGill University Health Centre
Mots-clésMethylenetetrahydrofolate reductaseMelting curve analysisMutationGeneticsBiologyMedicineGenePolymerase chain reactionGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR; E.C. 1.5.1.20) catalyzes the reduction of 5,10-methylenetetrahydofolate to 5-methytetrahydrofolate, and its activity is affected by a number of polymorphisms and mutations, the best known being MTHFR c.677C > T (OMIM 607093.003). The c.677C > T mutation is often analyzed by melting curve analysis after real-time polymerase chain reaction. We observed in one patient upon dual hybridization probe analysis in a Roche LightCycler 1.2 an unusual melting curve peak at 53.4 degrees C instead of one expected at either 51.6 degrees C or 60.4 degrees C. We sequenced the region of MTHFR interrogated by the dual hybridization probes, which revealed a c.685A > G base substitution that would result in an Ile225Val substitution. In conclusion, we identified the cause of an unusual melting curve in a commonly used genotyping technique for MTHFR c.677C > T as due to a novel mutation highlighting the ability of melting analysis to identify new sequence variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle