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Enregistrement W2093698246 · doi:10.1111/j.1550-7408.2003.tb00145.x

Molecular Phylogeny and Surface Morphology of <i>Colpodella edax</i> (Alveolata): Insights into the Phagotrophic Ancestry of Apicomplexans

2003· article· en· W2093698246 sur OpenAlexafffund
Brian S. Leander, Olga N. Kuvardina, В. В. Алешин, Alexander P. Mylnikov, Patrick J. Keeling

Notice bibliographique

RevueJournal of Eukaryotic Microbiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensCanadian Institute for Advanced Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCNational Science Foundation
Mots-clésBiologyMorphology (biology)Evolutionary biologyPhylogeneticsZoologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The molecular phylogeny of colpodellids provides a framework for inferences about the earliest stages in apicomplexan evolution and the characteristics of the last common ancestor of apicomplexans and dinoflagellates. We extended this research by presenting phylogenetic analyses of small subunit rRNA gene sequences from Colpodella edax and three unidentified eukaryotes published from molecular phylogenetic surveys of anoxic environments. Phylogenetic analyses consistently showed C. edax and the environmental sequences nested within a colpodellid clade, which formed the sister group to (eu)apicomplexans. We also presented surface details of C. edax using scanning electron microscopy in order to supplement previous ultrastructural investigations of this species using transmission electron microscopy and to provide morphological context for interpreting environmental sequences. The microscopical data confirmed a sparse distribution of micropores, an amphiesma consisting of small polygonal alveoli, flagellar hairs on the anterior flagellum, and a rostrum molded by the underlying (open-sided) conoid. Three flagella were present in some individuals, a peculiar feature also found in the microgametes of some apicomplexans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,558

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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