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Enregistrement W2093839301 · doi:10.1111/jnc.12626

Transcriptional regulation of human <scp>USP</scp>24 gene expression by NF‐kappa B

2013· article· en· W2093839301 sur OpenAlexafffund
Ke Wang, Shengchun Liu, Juelu Wang, Yili Wu, Fang Cai, Weihong Song

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésEnhancerMolecular biologyBiologyPromoterGeneTranscription factorTATA boxReporter geneGene expressionTranscriptional regulationElectrophoretic mobility shift assayTranscription (linguistics)CAAT boxRegulation of gene expressionRegulatory sequenceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Impairment of the ubiquitin proteasome pathway is believed to play an important role in the pathogenesis of Parkinson's disease. This process is carried out under tight regulation by deubiquitinating enzymes. Genetic linkage studies indicated that the region of the human ubiquitin‐specific protease 24 (USP24) gene is significantly correlated with Parkinson's disease. In this study, we cloned a 1648 bp 5′ flanking region of the human USP24 gene coding sequence and a series of nested deletions into the pGL3‐Basic vector. We analyzed promoter activities of these regions with a luciferase‐based reporter assay system. A 64‐bp region was identified to contain the transcription initiation site and a minimum promoter sequence for transcriptional activation of the USP24 gene expression. Expression of USP24 is controlled by a TATA‐box‐less promoter with several putative cis‐acting elements. Transcriptional activation and gel‐shift assay demonstrated that the USP24 gene promoter contains a functional NFκB‐binding site. Over‐expression of nuclear factor kappa‐light‐chain‐enhancer of activated B cells (NFκB) and tumor‐necrosis factor alpha (TNFα) treatment significantly increased the USP24 promoter activity, mRNA expression and protein level in human HEK293 cells, mouse N2a cells and human neuroblastoma SH‐SY5Y cells. Deletion and mutation of the binding site abolished the regulatory effect of NFκB on human USP24 gene transcription. These results suggested that USP24 expression is tightly regulated at its transcription level and NFκB plays an important role in this process. image Impairment of the ubiquitin proteasome system (UPS) has been implicated in neurodegenerative disorders. This report showed that the expression of human ubiquitin‐specific protease 24 (USP24), a deubiquitinating enzyme of UPS, is tightly regulated by NFκB. The results suggest that dysregulation of NFκB‐mediated USP24 expression may play a role in PD pathogenesis and modulating this process could have therapeutic potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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