Recruitment of Histone Deacetylase 3 to the Interferon-A Gene Promoters Attenuates Interferon Expression
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Induction of Type I Interferon (IFN) genes constitutes an essential step leading to innate immune responses during virus infection. Sendai virus (SeV) infection of B lymphoid Namalwa cells transiently induces the transcriptional expression of multiple IFN-A genes. Although transcriptional activation of IFN-A genes has been extensively studied, the mechanism responsible for the attenuation of their expression remains to be determined. PRINCIPAL FINDINGS: In this study, we demonstrate that virus infection of Namalwa cells induces transient recruitment of HDAC3 (histone deacetylase 3) to IFN-A promoters. Analysis of chromatin-protein association by Chip-QPCR demonstrated that recruitment of interferon regulatory factor (IRF)3 and IRF7, as well as TBP correlated with enhanced histone H3K9 and H3K14 acetylation, whereas recruitment of HDAC3 correlated with inhibition of histone H3K9/K14 acetylation, removal of IRF7 and TATA-binding protein (TBP) from IFN-A promoters and inhibition of virus-induced IFN-A gene transcription. Additionally, HDAC3 overexpression reduced, and HDAC3 depletion by siRNA enhanced IFN-A gene expression. Furthermore, activation of IRF7 enhanced histone H3K9/K14 acetylation and IFN-A gene expression, whereas activation of both IRF7 and IRF3 led to recruitment of HDAC3 to the IFN-A gene promoters, resulting in impaired histone H3K9 acetylation and attenuation of IFN-A gene transcription. CONCLUSION: Altogether these data indicate that reversal of histone H3K9/K14 acetylation by HDAC3 is required for attenuation of IFN-A gene transcription during viral infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».