MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2093896106 · doi:10.1039/c2an15887f

Elucidation of matrix effects and performance of solid-phase extraction for LC-MS/MS analysis of β-N-methylamino-l-alanine (BMAA) and 2,4-diaminobutyric acid (DAB) neurotoxins in cyanobacteria

2012· article· en· W2093896106 sur OpenAlexafffund
Aifeng Li, Hua Fan, Feifei Ma, Pearse McCarron, Krista Thomas, Xianghai Tang, Michael A. Quilliam

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmino Acid Enzymes and Metabolism
Établissements canadiensInstitute for Marine Biosciences
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Research Council Canada
Mots-clésChemistryChromatographyCyanobacteriaSolid phase extractionMicrocystis aeruginosaHydrophilic interaction chromatographyMass spectrometryExtraction (chemistry)AlanineMatrix (chemical analysis)Liquid chromatography–mass spectrometryLysineHigh-performance liquid chromatographyAmino acidBacteriaBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS/MS) method using hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) was developed for the analysis of neurotoxins β-N-methylamino-L-alanine (BMAA) and 2,4-diaminobutyric acid (DAB), using multiple reaction monitoring (MRM) scan mode. Oasis-MCX and Strata-X-C polymeric cation-exchange cartridges were used to clean extracts of cyanobacterial cultures, including two strains of Microcystis aeruginosa and one strain of Nostoc sp. The performance of the solid-phase extraction (SPE) cartridges for BMAA and DAB were evaluated using mixed standards and spiked cyanobacterial extracts, which demonstrated recoveries of BMAA and DAB ranging from 66% to 91%. Matrix effects in LC-MS/MS were evaluated, and while there was no effect on BMAA quantitation, suppression of DAB was found. Full scan (Q1) and enhanced product ion (EPI) monitoring showed that the DAB suppression may be due to closely eluting compounds, including lysine, histidine, arginine and three other compounds with [M + H](+) m/z of 88, 164 and 191. The procedures developed allow the sensitive and effective analysis of trace BMAA and DAB levels in cyanobacteria. While DAB was confirmed to be present, no BMAA was found in the cyanobacterial samples tested in the present study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,297
Score d'incertitude au seuil0,392

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe AnalystMême sujetAmino Acid Enzymes and MetabolismTravaux en français237 207