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Enregistrement W2093947711 · doi:10.3389/fpls.2013.00493

Reprogramming cells to study vacuolar development

2013· article· en· W2093947711 sur OpenAlexafffund
Mistianne Feeney, Lorenzo Frigerio, Susanne E. Kohalmi, Yuhai Cui, Rima Menassa

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaWestern University
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilAgriculture and Agri-Food CanadaLeverhulme Trust
Mots-clésVacuoleBiologyArabidopsisCell biologyReprogrammingLeafyArabidopsis thalianaOrganelleBotanyGeneticsCytoplasmCellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During vegetative and embryonic developmental transitions, plant cells are massively reorganized to support the activities that will take place during the subsequent developmental phase. Studying cellular and subcellular changes that occur during these short transitional periods can sometimes present challenges, especially when dealing with Arabidopsis thaliana embryo and seed tissues. As a complementary approach, cellular reprogramming can be used as a tool to study these cellular changes in another, more easily accessible, tissue type. To reprogram cells, genetic manipulation of particular regulatory factors that play critical roles in establishing or repressing the seed developmental program can be used to bring about a change of cell fate. During different developmental phases, vacuoles assume different functions and morphologies to respond to the changing needs of the cell. Lytic vacuoles (LVs) and protein storage vacuoles (PSVs) are the two main vacuole types found in flowering plants such as Arabidopsis. Although both are morphologically distinct and carry out unique functions, they also share some similar activities. As the co-existence of the two vacuole types is short-lived in plant cells, how they replace each other has been a long-standing curiosity. To study the LV to PSV transition, LEAFY COTYLEDON2, a key transcriptional regulator of seed development, was overexpressed in vegetative cells to activate the seed developmental program. At the cellular level, Arabidopsis leaf LVs were observed to convert to PSV-like organelles. This presents the opportunity for further research to elucidate the mechanism of LV to PSV transitions. Overall, this example demonstrates the potential usefulness of cellular reprogramming as a method to study cellular processes that occur during developmental transitions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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