High-Spatial Resolution Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Imaging Analysis of Glucosylceramide in Spleen Sections from a Mouse Model of Gaucher Disease
Notice bibliographique
Résumé
MALDI mass spectrometric imaging (MSI) enables spatially resolved mass and intensity information to be obtained directly from tissue sections, thereby illustrating how analytes are distributed within these sections. Here we have used an oversampling technique on a commercially available MALDI orthogonal acceleration TOF mass spectrometer with ion mobility separation capability to produce high spatial resolution images of the glycosphingolipid, glucosylceramide (GC). To exemplify the biological application of our approach, GC was imaged in spleen sections from a conditional knockout mouse model of type 1 Gaucher disease in which the catabolism of this glycosphingolipid is impaired. The laser was continually fired at one position until no more ions were observed and then the sample was moved by 15 microm (laser diameter approximately 150 microm). Ions were generated from only the unirradiated surface at each of these positions achieving an effective spacing of 15 microm. At 15 microm laser step-size, it was possible to visualize macrophages enriched in GC, which could be distinguished from other cell types in the spleen. Current MALDI MSI spatial resolution is typically limited by the diameter of the laser spot-size, which is usually between 50 and 100 microm, covering an area equivalent to tens of mammalian cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».