Modification of the rat airway explant transcriptome by cigarette smoke
Notice bibliographique
Résumé
Although a number of animal model studies have addressed changes in gene expression in the parenchyma and their relationship to emphysema, much less is known about the pathogenesis of cigarette smoke-induced small airway remodeling. In this study the authors exposed rat tracheal explants, a model of the airway wall, to whole smoke for 15 min, and then cultured the explants in air. The airway transcriptome was evaluated using RAE 230_2 gene chips. By 2 h after starting smoke exposure, expression levels of 502 genes were differentially expressed by more than 1.5 times (p < .01 or less) and by 24 h 1870 genes were significantly changed up or down. These included genes involved in antioxidant protection, epithelial defense and remodeling, inflammatory mediators and transcription factors, and a number of unexpected genes, including the matrix metalloproteinase (MMP)-12 inducer, tachykinin-1 (substance P). Pretreatment of the explants with 1 x 10(-7) M dexamethasone reduced the number of significantly changed genes by approximately 47% at 2 h and 68% at 24 h and in almost all instances reduced the magnitude of the smoke-induced changes. The authors conclude that even a very brief exposure to cigarette smoke can lead to rapid changes in the expression of a large number of genes in rat tracheal explants, and that these effects are directly mediated by smoke, without a need for exogenous inflammatory cells. Steroids, contrary to the usual belief, are able to ameliorate many of these changes, at least in this very acute model.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».