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Enregistrement W2094277111 · doi:10.1007/s12192-008-0049-x

Endoplasmic reticulum stress in the absence of calnexin

2008· article· en· W2094277111 sur OpenAlexafffund
Helen Coe, Karen Bedard, Jody Groenendyk, Joanna Jung, Marek Michalak

Notice bibliographique

RevueCell Stress and Chaperones · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation pour la Recherche MédicaleHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésCalnexinXBP1Endoplasmic reticulumUnfolded protein responseCell biologyMessenger RNABiologyMolecular biologyRNA splicingCalreticulinGeneRNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calnexin is a type I integral endoplasmic reticulum (ER) membrane chaperone involved in folding of newly synthesized (glycol)proteins. In this study, we used beta-galactosidase reporter gene knock-in and reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) to investigate activation of the calnexin gene during embryonic development. We showed that the calnexin gene was activated in neuronal tissue at the early stages of embryonic development but remained low in the heart, intestine, and smooth muscle. At early stages of embryonic development, large quantities of calnexin messenger RNA (mRNA) were also found in neuronal tissue and liver. There was no detectable calnexin mRNA in the heart, lung, and intestine. The absence of calnexin had no significant effect on ER stress response (unfolded protein response, UPR) at the tissue level as tested by IRE1-dependent splicing of Xbp1 mRNA. In contrast, non-stimulated calnexin-deficient cells showed increased activation of IRE1, as measured by RT-PCR and luciferase reporter gene analysis of splicing of Xbp1 mRNA and activation of the BiP promoter. This indicates that cnx (-/-) cells have increased constitutively active UPR. Importantly, cnx (-/-) cells have significantly increased proteasomal activity, which may play a role in the adaptive mechanisms addressing the acute ER stress observed in the absence of calnexin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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