MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2094398065 · doi:10.1359/jbmr.2003.18.10.1748

Three Novel Mutations in SQSTM1 Identified in Familial Paget's Disease of Bone

2003· article· en· W2094398065 sur OpenAlexaboutno aff
Teresa L. Johnson‐Pais, Julie H Wisdom, Korri Weldon, Jannine D. Cody, Marc F. Hansen, Frederick R. Singer, Robin J. Leach

Notice bibliographique

RevueJournal of Bone and Mineral Research · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone health and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesLasker FoundationEli and Edythe Broad Foundation
Mots-clésSequestosome 1Paget's disease of boneExonGeneticsTransversionMutationBiologyMissense mutationPedigree chartGeneMedicineDiseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: Mutations in Sequestosome 1 (SQSTM1) have been shown to segregate with familial Paget's disease of bone (PDB). We examined the coding sequence of SQSTM1 in five PDB pedigrees and found three novel mutations clustered around the C-terminal ubiquitin associated domain. Disruptions of the C-terminal domain of SQSTM1 seem to be a leading cause of familial PDB. INTRODUCTION: The characteristic features of Paget's disease of bone (PDB) are caused by focal areas of excessive and uncoordinated bone remodeling. A total of seven genetic loci (PDB1-PDB7) have been reported to be associated with the disease. The gene for Sequestosome 1 (p62; SQSTM1) has been identified as the causative gene for PDB3 in numerous French-Canadian families and families predominantly of British descent. To date, a total of three mutations, all affecting the ubiquitin-associated domain of SQSTM1, have been identified: a single 1215 C to T (P392L) transversion in exon 8, a T insertion in exon 8 (E396X), and a G to A mutation at the splice junction of exon 7 (IVS7 + 1). MATERIALS AND METHODS: DNA was isolated from blood collected from the members of five U.S. PDB pedigrees. Mutation analysis of the coding sequence of the SQSTM1 gene was performed on the proband and other key individuals in the pedigrees. RESULTS: Four of the five families had SQSTM1 mutations. Three of these mutations were novel: a single base deletion in exon 8 at position 1210 (1210delT) resulting in a premature stop codon at amino acid 394, a single C deletion in exon 8 at position 1215 (1215delC) also resulting in a premature stop codon at amino acid 394, and a single 1200 C to T (P387L) transversion in exon 7. CONCLUSION: Noteworthy is the fact that these three SQSTM1 mutations, in addition to the three previously described mutations, are clustered near the C-terminal of the protein. These mutations may be acting in a dominant-negative fashion to disrupt the ubiquitin-binding function, which could result in abnormal activation of the NF-kappaB pathway and the subsequent activation of the osteoclasts. These findings imply that SQSTM1 mutations may play a role in the majority of familial PDB in the United States.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Bone and Mineral ResearchMême sujetBone health and treatmentsTravaux en français237 207