Molecular Cloning and Characterization of Tetrahydroprotoberberine cis-N-Methyltransferase, an Enzyme Involved in Alkaloid Biosynthesis in Opium Poppy
Notice bibliographique
Résumé
S-Adenosyl-l-methionine:tetrahydroprotoberberine cis-N-methyltransferase (EC 2.1.1.122) catalyzes the conversion of (S)-stylopine to the quaternary ammonium alkaloid, (S)-cis-N-methylstylopine, as a key step in the biosynthesis of protopine and benzophenanthridine alkaloids in plants. A full-length cDNA encoding a protein exhibiting 45 and 48% amino acid identity with coclaurine N-methyltransferase from Papaver somniferum (opium poppy) and Coptis japonica, respectively, was identified in an elicitor-treated opium poppy cell culture expressed sequence tag data base. Phylogenetic analysis showed that the protein belongs to a unique clade of enzymes that includes coclaurine N-methyltransferase, the predicated translation products of the Arabidopsis thaliana genes, At4g33110 and At4g33120, and bacterial S-adenosyl-L-methionine-dependent cyclopropane fatty acid synthases. Expression of the cDNA in Escherichia coli produced a recombinant enzyme able to convert the protoberberine alkaloids stylopine, canadine, and tetrahydropalmatine to their corresponding N-methylated derivatives. However, the protoberberine alkaloids tetrahydroxyberbine and scoulerine, and simple isoquinoline, benzylisoquinoline, and pavine alkaloids were not accepted as substrates, demonstrating the strict specificity of the enzyme. The apparent K(m) values for (R,S)-stylopine and S-adenosyl-L-methionine were 0.6 and 11.5 microm, respectively. TNMT gene transcripts and enzyme activity were detected in opium poppy seedlings and all mature plant organs and were induced in cultured opium poppy cells after treatment with a fungal elicitor. The enzyme was detected in cell cultures of other members of the Papaveraceae but not in species of related plant families that do not accumulate protopine and benzophenanthridine alkaloids.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».