MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2094718666 · doi:10.1128/jb.01617-12

Glycopeptide Sulfation Evades Resistance

2012· article· en· W2094718666 sur OpenAlexafffund
Lindsay Kalan, Julie Perry, Kalinka Koteva, Maulik Thaker, Gerard D. Wright

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGlycopeptideBiologySulfationMicrobiologyVancomycinBiochemistryGlycopeptide antibioticAntibioticsGlycosylationGlycanStaphylococcus aureusGlycoproteinBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The incidence of antibiotic resistance among pathogenic microorganisms is increasing at an alarming rate. Resistance against front-line therapeutics such as the glycopeptide antibiotic vancomycin has emerged and has spread to highly virulent pathogens, including Staphylococcus aureus. Glycopeptide antibiotics are natural products from the Actinomycetes that have a characteristic heptapeptide core. The chemical diversity of the class is achieved through glycosylation, halogenation, methylation, and acylation of the core, modifications that are implicated in improved solubility, stability, or activity of the molecule. Sulfation is yet another modification observed infrequently in glycopeptides, but its role is not known. Although glycopeptide sulfotransferases are found in the environmental metagenome and must therefore serve an evolutionary purpose, all previous studies have reported decreased antibiotic activity with sulfation. We report that sulfation of glycopeptides has little effect on the compound's ability to bind its target, the d-Ala-d-Ala peptidoglycan precursors of the bacterial cell wall. However, sulfation does impact glycopeptide dimerization, and importantly, sulfated glycopeptides are significantly less potent inducers of the resistance gene cluster vanHAX in actinomycetes. Our results begin to unravel the mystery of the biological role of glycopeptide sulfation and offer a potential new strategy for the development of new antibiotics that avoid resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of BacteriologyMême sujetMicrobial Natural Products and BiosynthesisTravaux en français237 207