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Enregistrement W2094782263 · doi:10.1111/j.1439-0388.2008.00796.x

<i>Stearoyl‐CoA desaturase 1</i> 3′UTR SNPs and their influence on milk fatty acid composition of Canadian Holstein cows

2009· article· en· W2094782263 sur OpenAlex
Patrick Monametsi Kgwatalala, Eveline M. Ibeagha‐Awemu, Joseph Hayes, Xin Zhao

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Breeding and Genetics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensMcGill UniversitySte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismConjugated linoleic acidStearoyl-CoA DesaturaseBreedBiologyUntranslated regionGeneticsHaplotypeGeneFatty acidLinoleic acidGenotypeMessenger RNABiochemistryGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stearoyl-CoA desaturase 1 (SCD1) catalyses the synthesis of conjugated linoleic acid (CLA) and mono-unsaturated fatty acids (MUFA) in the mammary gland of ruminant animals. Considerable variations in CLA and MUFA have been reported among animals of the same contemporary group. We hypothesized that single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5' and 3' untranslated regions (UTRs) of the SCD1 gene would influence the production of SCD1 enzyme and consequently its activity in the mammary gland, which may account for some of the observed within breed variations in CLA and MUFA. The 5' and 3'UTRs of the SCD1 gene of 46 Holsteins and 35 Jerseys were analysed for SNPs by sequencing. No SNPs were identified in the 5'UTR, while 14 SNPs were identified in the 3'UTR region. Further analysis revealed three haplotype structures or regulatory variants in Holsteins: named H1, H2 and H3 and only H1 and H3 in Jerseys. An IRES motif was found in the H1 variant. A subsequent association study involving the milk fatty acid profiles of 862 Holstein cows found the H1 regulatory variant to be associated with higher C10 and C12 desaturase indices and consequently with higher contents of C10:1 and C12:1 relative to the H3 variant. The effects of the H2 variant were intermediate to those of H1 and H3. SNPs in the 3'UTR of the SCD1 gene could therefore explain some of the within-breed variations in MUFA content of milk fat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,404
Score d'incertitude au seuil0,507

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle