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Enregistrement W2095043185 · doi:10.1128/jcm.00405-07

Abilities of APTIMA, AMPLICOR, and ProbeTec Assays To Detect <i>Chlamydia trachomatis</i> and <i>Neisseria gonorrhoeae</i> in PreservCyt ThinPrep Liquid-Based Pap Samples

2007· article· en· W2095043185 sur OpenAlexaff
Max Chernesky, D. Jang, E. Portillo, S. Chong, Marek Smieja, K. Luinstra, Astrid Petrich, Cindy MacRitchie, Ruth Ewert, Beth Hayhoe, Alicia Sarabia, FM Thompson

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeisseria gonorrhoeaeChlamydia trachomatisNeisseriaceaeVirologyChlamydialesChlamydiaceaeMedicineMicrobiologyBiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infections with Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae are often asymptomatic. Liquid-based Pap (L-Pap) screening may provide samples for testing by commercial assays. Women attending a health clinic or a street youth clinic had a PreservCyt ThinPrep sample and a cervical swab (CS) collected. The L-Pap sample was tested for cytopathology; then 1 ml was transferred to an L-Pap specimen transfer tube for testing by the Gen-Probe APTIMA assays (APTIMA Combo 2 [AC2], APTIMA C. trachomatis [ACT], and APTIMA N. gonorrhoeae [AGC]). The residual L-Pap sample was tested for C. trachomatis and N. gonorrhoeae using Roche AMPLICOR (AMP) and Becton Dickinson ProbeTec (PT). The CS was tested by AC2. A patient was considered infected if two specimens were positive or if a single specimen was positive in two tests. The prevalence of infection was 10% (29/290) for C. trachomatis and 2.4% (7/290) for N. gonorrhoeae. Most of the positive patients had specimens that were reactive in all assays (20/29 for C. trachomatis; 6/7 for N. gonorrhoeae). Four patients had double infections. The sensitivities and specificities of the various tests for the specimens tested were as follows. For C. trachomatis on L-Pap, sensitivity and specificity were 100 and 98.1%, respectively, for ACT, 93.1 and 98.8% for AC2, 86.2 and 91.2% for AMP, and 72.4 and 92.7% for PT. For N. gonorrhoeae on L-Pap, sensitivity and specificity were 100% for both AGC and AC2, 85.7 and 100% for AMP, and 85.7 and 100% for PT. For AC2 with CSs, sensitivity and specificity were 93.1 and 98.5%, respectively, for C. trachomatis, and both were 100% for N. gonorrhoeae. There were significant differences in sensitivity and specificity (P < 0.001). The APTIMA assays were more sensitive and specific than AMP or PT for detecting women's C. trachomatis and/or N. gonorrhoeae infections by testing ThinPrep samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,539
Score d'incertitude au seuil0,883

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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