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Enregistrement W2095066446 · doi:10.1139/w08-090

Heterogeneity in enterohemorrhagic<i>Escherichia coli</i>O157:H7 fecal shedding in cattle is related to<i>Escherichia coli</i>O157:H7 colonization of the small and large intestine

2008· article· en· W2095066446 sur OpenAlexafffundvenue
Danica Baines, Byron Lee, Tim A. McAllister

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesBeef Cattle Research Council
Mots-clésEscherichia coliColonizationMicrobiologyFecesBiologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the last decade, Escherichia coli O157:H7 have emerged as important pathogens of the gastrointestinal tract of humans. Healthy cattle have been identified as the primary reservoir, however, the factors affecting heterogeneous E. coli O157:H7 fecal shedding are not fully understood. The aim of this study was to investigate the contribution of E. coli O157:H7 colonization of small and large intestinal sites to the heterogeneity of fecal shedding in cattle. There was a dose-dependant E. coli O157:H7 E318N colonization of duodenum, jejunum, ileum, cecum, ascending colon, spiral colon, descending colon, and the rectoanal junction in vitro with no difference in E. coli O157:H7 colonization of the rectoanal junction and other intestinal sites. There were 10-100 times greater E. coli O157:H7 colonization of intestinal sites from persistent shedding cattle compared with non persistent shedding cattle. Novel pathologies were associated with E. coli O157:H7 colonization sites in the small and large intestine. The first pathology, focal petechiae, was present throughout the intestinal tract of cattle that ceased shedding E. coli O157:H7 for 5-12 weeks or in the jejunum, ileum, cecum, and ascending colon of cattle shedding E. coli O157:H7 for 4-5 months. The second pathology, mucosal hemorrhages, was present in the same sites as the focal petechiae in cattle shedding for 5 months and these hemorrhages were in the final stages of repair. Several features of these hemorrhages support this conclusion including the brown appearance, low amount of classic E. coli O157:H7 induced A/E lesions, flattened epithelium, and blunted villi. Although mucosal hemorrhages were present in the jejunum, ileum, cecum, and ascending colon in cattle shedding for 4 months, many other pathologies were also present that were indicative of hemorrhagic enteritis as evidenced by the blood red appearance of hemorrhages, severe edema, and dark red erythema. Escherichia coli O157:H7 were associated with both pathologies suggesting it is the causative agent. The current study supports a relationship between the amount of E. coli O157:H7 colonization in intestinal sites and heterogeneous fecal shedding by cattle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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