A rapid assay for mitochondrial DNA damage and respiratory chain inhibition in the yeast <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Notice bibliographique
Résumé
There is a need for a rapid assay to identify agents that damage mitochondria because the mitochondrion may be an important target for numerous environmental mitotoxins. Certainly at least one chemotherapeutic regimen (CHOP therapy) that includes doxorubicin can induce cardiomyopathy through mitochondrial genotoxicity in cardiac muscle cells. Yeast cells (1.5 x 10(6)-10(7)) in water are spread on a YEPD plate, and, when the suspension of cells has dried, a small well (12 mm diameter) is cut into the agar; 200-400 microl of a solution of the presumptive mitochondrial genotoxin is placed in the well, and the plates are incubated for 2 days. The genotoxin forms a concentration gradient through the agar and affects the growing cells. An overlay containing tetrazolium chloride is added, and the plates are incubated for 6-24 hr. Respiring cells turn red, and nonrespiring cells, with damaged DNA or inhibited respiratory chains, that are adjacent to the well, are white. A white ring, or a more lightly colored red ring, around the well indicates the presence of cells with lowered respiratory activity which may be fully reversible when the mitochondrial genotoxin is removed. In preliminary experiments, doxorubicin (= adriamycin) shows strong activity with this assay; cyclophosphamide is negative, and 4-hydroxycyclophosphamide, a metabolite of cyclophosphamide, is weakly positive. Ethidium bromide, methotrexate, 5-fluorouracil, and 5-fluorocytosine also are mitochondrial genotoxins. Antifungal agents similar to 5-fluorocytosine and anthelmintic compounds such as pyrvinium iodide can be powerful mitochondrial genotoxins.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».