Gold Nanoparticle Enrichment Method for Identifying <i>S</i>-Nitrosylation and <i>S</i>-Glutathionylation Sites in Proteins
Notice bibliographique
Résumé
We present a simple method by which gold nanoparticles (AuNPs) are used to simultaneously isolate and enrich for free or modified thiol-containing peptides, thus facilitating the identification of protein S-modification sites. Here, protein disulfide isomerase (PDI) and dual specificity phosphatase 12 (DUSP12 or hYVH1) were S-nitrosylated or S-glutathionylated, their free thiols differentially alkylated, and subjected to proteolysis. AuNPs were added to the digests, and the AuNP-bound peptides were isolated by centrifugation and released by thiol exchange. These AuNP-bound peptides were analyzed by MALDI-TOF mass spectrometry revealing that AuNPs result in a significant enrichment of free thiol-containing as well as S-nitrosylated, S-glutathionylated, and S-alkylated peptides, leading to the unequivocal assignment of thiols susceptible to modification.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».